عملکرد موتورفن به این صورت است که وقتی موتور خودرو در حال کار است و دمای آن افزایش می ‌یابد، موتور فن فعال می ‌شود و هوای محیط را از طریق رادیاتور که سیستم خنک‌کننده موتور است، عبور می ‌دهد. این عبور هوا از رادیاتور به کمک فن موتور، باعث سرعت بالای جریان هوا می‌ شود که دمای موتور را کاهش می‌ دهد.